William Mackenzie gründete Dailuaine 1851 in einem kleinen Waldstück etwa eine Meile von der Hauptstraße entfernt, am anderen Ende (Nordende) des Anwesens Ballindalloch, gegenüber von Cragganmore. Zwölf Jahre später wurde die Speyside-Bahn bis Carron auf das gegenüberliegende Ufer des Flusses gebaut und über eine öffentliche Straßenbrücke mit der Destillerie verbunden, was Dailuaine den Marktzutritt erheblich erleichterte. Die Destillerie wurde 1884 wiederaufgebaut, und Alfred Barnard bemerkte bei seinem Besuch 1887: 'In den vergangenen Jahren wurde die gesamte Destillerie fast vollständig erneuert, in einem größeren, moderneren Stil wiederaufgebaut und umfasst nun alle neuesten Fortschritte der Destillierungstechnik.' Sie war eine der größten Highland-Destillerien ihrer Zeit. Mackenzie wandelte das Unternehmen 1890 in eine Limited Company um und fusionierte 1898 mit Talisker zur Dailuaine-Talisker Distilleries Ltd. Zu dieser Zeit lag die Geschäftsführung in den Händen von Mackenzies Sohn Thomas, der im Vorjahr die Imperial Distillery gegründet hatte. Thomas starb 1915 ohne Nachfolger, und Dailuaine-Talisker wurde von ihren Hauptkunden Walker's, Dewar's, W.P. Lowrie und D.C.L. übernommen. 1917 zerstörte ein großes Feuer den größten Teil des Anwesens, das anschließend wiederaufgebaut wurde. Die Destillerie wurde zwischen 1959 und 1960 umfassend rekonstruiert; die Bodenmälzerei wurde in ein Saladin-Box-System umgewandelt, die Anzahl der Brennblasen von vier auf sechs erhöht und mechanische Kohleheizung eingeführt (1970 auf indirekte Heizung umgestellt). Gleichzeitig wurde auch eine Schlempeanlage installiert. Bis 1983 wurde lokal angebaute Gerste verwendet. Dailuaine war von Anfang an für die Produktion von Whisky für Blends und Maltwhisky konzipiert und wurde erst 1991 als Single Malt abgefüllt.

Das Pagodendach der Dailuaine Destillerie – das später zum Mainstream für Maltwhisky-Brennereien wurde – wurde 1917 durch ein Feuer zerstört. Die Brennerei erlitt 1959 ein weiteres Feuer, das den zuvor erwähnten Wiederaufbau auslöste. Im Jahr 1897 kaufte die Destillerie eine 0-4-0 Satteltanklokomotive von Barclay of Kilmarnock, um Waren zum Bahnhof Carron zu transportieren. Sie war bis 1939 im Einsatz, als sie durch eine andere Lokomotive desselben Herstellers ersetzt wurde, die später "Dailuaine No. 1" genannt wurde. Ihre leuchtende Lackierung und polierten Messingteile veranlassten einen ehemaligen Lokführer zu dem Ausruf: "Äußerst ansprechend für das Auge." Nach der Schließung der Speyside-Bahnstrecke 1967 wurde die Lokomotive dem Eisenbahnmuseum in Aviemore geschenkt. Später wurde sie an U.D. (United Distillers) zurückgegeben und ist derzeit in der Aberfeldy Destillerie ausgestellt.