Den größten Teil seiner Existenz wurde die Brora-Destillerie als „Clynelish“ bezeichnet, aber 1967 wurde eine neue Destillerie mit demselben Namen nebenan gebaut. Das Original wurde für ein Jahr stillgelegt und dann als Clynelish No. 2 wiedereröffnet, bis es 1975 in „Brora“ umbenannt wurde. Die Destillerie wurde im Mai 1983 geschlossen und der größte Teil ihrer Ausrüstung wurde abgebaut. Die eleganten alten Gebäude stehen noch immer, die Lagerhäuser werden von Clynelish genutzt. Die 1819 vom Marquess of Stafford (später 1. Duke of Sutherland) gegründete Clynelish/Brora war Teil seiner Verbesserungspläne für die riesigen nördlichen Güter seiner Frau. Um Platz für Schafzucht zu schaffen, erforderte dieser Plan auch die Räumung von etwa 15.000 Pächtern vom Land, von denen einige gewaltsam in neue Küstenstädte wie Brora umgesiedelt wurden. Die ersten 70 Jahre kämpfte die Destillerie, einzelne Eigentümer wurden in den Bankrott getrieben. Dann wurde sie 1896 von James Ainslie & Company (Glasgow Blenders) in Partnerschaft mit John Risk (Eigentümer der Bankier Distillery bei Falkirk) gekauft und wiederaufgebaut. 1912 erwarb Letzterer in Partnerschaft mit D.C.L. das volle Eigentum. Nach 1916 entstand auch eine Partnerschaft mit John Walker & Sons. 1925 fusionierten John Walker & Sons (zusammen mit Clynelish/Brora) mit D.C.L., wodurch das Risiko verteilt wurde. Seitdem wurde der Whisky der Marke in den Blends von John Walker & Sons verwendet. 1961 wurden die beiden Brennblasen der Destillerie von direkter Kohlenheizung auf Innendampfheizung umgestellt, und 1965 wurden die Dampfmaschine und das Wasserrad durch Elektrizität ersetzt, wobei die Bodenmalzerei im selben Jahr eingestellt wurde. Zwischen Mai 1979 und Juli 1983 produzierte Brora/Clynelish einen stark getorften Malzwhisky für Blends. Im November 2017 kündigte Diageo überraschend an, die Destillerien Brora und Port Ellen vor 2020 wieder in Betrieb zu nehmen, mit einer Investition von etwa 35 Millionen Pfund. Der Plan sieht vor, die Ausrüstung und Prozesse der früheren Destillerie zu replizieren und dabei die Kapazität von Brora auf 800.000 Liter reinen Alkohols zu bringen.

Professor George Saintsbury, der große viktorianische Kenner und Autor von „Notes from a Cellar Book“, schätzte Brora/Clynelish äußerst hoch ein. Die Brennerei und ihre Lagerhäuser sind als historische Denkmäler eingetragen, wobei das meiste Originalgerät—Brennblasen, Gärbottiche, Maischbottiche—noch an Ort und Stelle ist. Tatsächlich kommentierte Harper's Weekly 1896: „Unter den Single Scotch Whiskys erzielen die Spirituosen dieser Brennerei immer die höchsten Preise. Sie werden—nach Zahlung der Steuern—an Privatkunden im gesamten Vereinigten Königreich geliefert; sie sind auch ein sehr wertvoller Ausfuhrartikel, wobei die Exportnachfrage so groß ist, dass die Eigentümer… jahrelang gezwungen waren, Handelsaufträge abzulehnen.“ Im Jahr 2002 begann Diageo mit der Veröffentlichung limitierter Jahrgangsabfüllungen von Brora, zunächst 30-jährig, ab 2008 25-jährig, und im Januar 2014 wurde Brora 40 Years Old eingeführt (exklusiv für Reisevertrieb, limitiert auf 260 Flaschen, empfohlener Verkaufspreis £6,995). Im Mai 2017 wurde eine Flasche Brora aus dem Jahr 1972 bei einer Auktion in Hongkong für HK$147,000 (ca. £13,900) verkauft.