Eden Mill wurde auf dem Gelände der Seggie-Destillerie erbaut, die 1810 von William Haig gegründet und später von seinem Bruder John übernommen wurde. John erwarb 1824 die Cameronbridge-Destillerie. Einige Originalgebäude sind bis heute erhalten. Seggie-Whisky wurde 1857 als Teil von Arthur Bell's Perth Blend aufgezeichnet. Die Destillerie war mindestens bis 1865 in Betrieb (als John Haig die Scotch Distillers Association gründete, die später D.C.L. wurde) und wurde 1872 in eine große Papierfabrik umgewandelt, die bis 2008 in Betrieb war. Das ursprüngliche Gelände wurde anschließend von der Universität St. Andrews gekauft. Ein Konsortium unter der Leitung von Paul Miller, ehemaliger Vertriebsleiter von Molson Coors und Marketingdirektor der Glenmorangie-Destillerie, pachtete einen Teil der alten Mühle, eröffnete 2012 eine Craft-Destillerie und steigerte die Whisky- und Ginproduktion im November 2014. Im Jahr 2015 wurden 100.000 Liter reiner Malzspiritus produziert, und die Eigentümer haben keine Pläne, die Kapazität zu erhöhen: 'Wir betreiben keine Massenproduktion. Wir füllen nur eine Handvoll Schweinskopffässer pro Woche, die an einer Hand abgezählt werden können. Weniger ist gut!' Neben Whisky produziert Eden Mill auch verschiedene Craft-Gins. Anfang 2018 begann die Destillerie mit dem Umzug, 70 Meter nördlich vom aktuellen Standort in das ursprüngliche Destilleriegebäude.

Die Eden Mill Distillery beschäftigt fünf Master Distiller mit akademischen Abschlüssen, wobei jeder Destillateur pro Woche die Menge eines Hogsheads produziert. Sie sind fest davon überzeugt, dass ihr 'Goldgehalt' pro Liter Spirituosen (gemessen an hochqualifizierten Destillateuren) alle anderen schottischen Destillerien übertrifft! Eden Mill ist auch führend bei der Entwicklung von Blended Whisky und der Reifung in kleinen Fässern und investiert erhebliche Zeit in diese Bemühungen. Sie haben Blended Whiskies veröffentlicht, die Unterschiede beim Fassfinishing in vier Fassarten aufzeigen: original Oloroso-Sherry-Fässer, amerikanische Virgin-Oak-Fässer, europäische Eichenfässer und Quarter Casks. Bemerkenswerterweise sind zwei ihrer Master Distiller auch professionell ausgebildete Fassbinder.