La triple distillation était autrefois assez courante dans les distilleries des Lowlands, dont beaucoup distillaient dans des alambics à pot des céréales autres que l'orge maltée, une pratique qui ajoutait de la délicatesse et du corps au whisky. Auchentoshan et Annandale sont les seules distilleries des Lowlands encore en activité qui utilisent la triple distillation, et avant 2014, elles comptaient parmi les seules quatre distilleries de whisky de malt encore en activité dans les Lowlands. Auchentoshan a été fondée en 1817 par le négociant en grains John Bulloch (sous le nom de Duntocher à l'époque), mais il a fait faillite en 1822. Son fils Archibald obtint une licence de distillation en vertu de la loi de 1823, mais connu également la faillite en 1826. En 1834, Duntocher fut vendue à John Hart et Alexander Filshie de Bulloch & Co. — ce dernier était un fermier local dont la famille habitait la région depuis le XVIIe siècle — à la condition que John Bulloch puisse continuer à vivre dans la distillerie (il mourut en 1846 à l'âge de 87 ans). John Hart et Alexander Filshie rebaptisèrent la distillerie Auchintoshan (mal orthographié), ce qui signifie « coin du champ ». La famille Filshie posséda la distillerie pendant 44 ans. Ils la reconstruisirent en 1875, mais après une récolte céréalière désastreuse en 1877, la vendirent aux négociants en whisky C.H. Curtis & Company de Greenock. C.H. Curtis & Company exploita Auchentoshan jusqu'en 1900. Au cours des trois années suivantes, la distillerie changea de propriétaire à deux reprises, la deuxième fois étant vendue à John and George McLachlan Ltd., une entreprise combinant brasseur, distillateur et négociant en vins et spiritueux. En 1960, elle fut acquise par le brasseur Tennent. Tennent fusionna avec Charrington en 1964 (devenant plus tard Bass Charrington), et en 1969 la distillerie fut vendue à Eadie Cairns pour environ 100 000 £. Ils rénovèrent l'usine, installèrent de nouveaux équipements et la vendirent à son propriétaire actuel, Suntory, en 1984. L'entreprise japonaise de brasserie et de distillerie Suntory acquit Morrison Bowmore en 1994, et en 2015 Suntory fusionna avec Jim Beam.

Auchentoshan est située à seulement 20 minutes à l'ouest de Glasgow, et son emplacement privilégié en fait une destination touristique populaire. La distillerie a rénové certaines installations en 2004 et 2008 pour améliorer l'expérience des visiteurs (certification 5 étoiles de l'office de tourisme écossais). Toute sa production est embouteillée en tant que whisky de malt single et commercialisée sous le nom de 'Glasgow's Malt Whisky.' La famille Bulloch a continué à jouer un rôle important dans l'industrie du whisky. La Bulloch Company a été fondée en 1830 et a été vendue peu après à D. T. Campbell. En 1855, le petit-fils de John Bulloch a dirigé une fusion avec la firme de whisky glasgowienne prospère A. Lade & Company pour former Bulloch Lade & Company, et a continué les acquisitions : Camlachie/Loch Katrine en 1856, Caol Ila en 1863, et Benmore à Campbeltown en 1868. La société vendait également une série de whiskys blendés renommés sous le nom générique 'B.L.,' et jusqu'en 1893, elle était l'agent exclusif de la distillerie Macallan-Glenlivet. En 1898, Bulloch Lade a été davantage corporatisée et a rejoint le D.C.L. en 1920. Le processus de distillation en trois étapes de la distillerie est le suivant : Le moût est introduit dans le wash still, et les low wines extraits sont envoyés au spent lees receiver n° 1, où ils sont mélangés avec les tails de l'intermediate still (degré d'alcool d'environ 18 % - 19 %). Le liquide du spent lees receiver n° 1 est introduit dans le plus petit intermediate still pour distillation, et les heads obtenus sont envoyés au spent lees receiver n° 2, où ils sont mélangés avec les tails du spirit still (degré d'alcool d'environ 55 %). Le liquide du spent lees receiver n° 2 est ensuite introduit dans le spirit still et distillé de manière habituelle ; les heads et les tails sont renvoyés au spent lees receiver n° 2, tandis que le heart est conservé dans le spirit receiver. La force alcoolique globale est très élevée, atteignant 82 %. En 2008, la distillerie a procédé à d'importantes rénovations de son emballage et de son liquide. Depuis le début du concours en 2003, Three Wood a atteint la finale du concours de whisky et de rhum cubain chaque année et a remporté la victoire en 2005 (jumelé avec des cigares Bolivar Inmensas).