Avant 1825, il y avait une distillerie au manoir d'Ury. Selon l'Aberdeen Journal de l'époque, un incendie a détruit la touraille de la distillerie. En 1838, un autre journal d'Aberdeen a déclaré que « la distillerie Glenugie a été initialement établie par le défunt comte de Gordon pour contrôler la contrebande », mais le journal n'a pas spécifié de date. Glenugie est apparu pour la première fois dans les registres des droits d'accise en 1833, révélant qu'il appartenait au major Robert Barclay (1779-1854), Laird d'Ury. L'ancêtre de Barclay avait acheté le domaine en 1648. Barclay lui-même avait été député de Kincardine, était quaker et agriculteur progressiste. Il a construit (ou reconstruit) la distillerie pour créer un marché pour l'orge locale. Il avait une amie à la cour qu'il appelait « Lady Windsor », et il a persuadé Guillaume IV de lui permettre d'utiliser « Royal » comme préfixe du nom de la distillerie après 1835. Après la mort de Barclay en 1847, la distillerie a été vendue à William Ritchie de Dunottar et est restée dans les mains de sa famille jusqu'en 1936. La famille Ritchie a ensuite vendu la distillerie à Joseph Hobbs pour £7 500. La distillerie était fermée depuis 1925, mais a repris la production en 1937. En 1938, Hobbs l'a vendue à Scottish Malt Distillers Ltd pour £18 500. Cette société était une filiale de la National Distillers Company américaine, qui avait contracté pour acquérir des distilleries : entre 1934-1938, ils ont successivement acheté Bruichladdich, Glenesk, Fettercairn, Glenlochy, Benromach et Strathdee, Glenugie devenant le siège social (voir « Ben Nevis Pennyfu »). En 1953, National Distillers s'est retirée d'Écosse et a vendu Scottish Malt Distillers Ltd et ses distilleries à D.C.L. (Bruichladdich et Fettercairn avaient déjà été vendues, et Strathdee avait fermé). Entre 1965-1966, Glenugie s'est étendue à quatre alambics et a fait l'objet d'une reconstruction majeure. La distillerie a fermé en 1985 et a été vendue à un promoteur immobilier huit ans plus tard.

Le capitaine Barclay était un homme au physique robuste et un athlète célèbre. En 1799, il marcha de Londres à Birmingham en passant par Cambridge—une distance de plus de 150 miles—en seulement deux jours. Deux ans plus tard, il marcha d'Ury à Boroughbridge dans le Yorkshire en cinq jours. Il était extrêmement populaire dans la région. En 1838, deux cents voisins l'invitèrent à dîner dans la salle de maltage de la distillerie.