William Mackenzie fonda Dailuaine en 1851 dans un petit bois d'environ un mile de la route principale, situé à l'autre extrémité (extrémité nord) du domaine de Ballindalloch, en face de Cragganmore. Douze ans plus tard, le chemin de fer de Speyside fut construit jusqu'à Carron sur la rive opposée de la rivière et relié à la distillerie par un pont routier public, ce qui facilita grandement l'accès de Dailuaine au marché. La distillerie fut reconstruite en 1884, et Alfred Barnard nota lors de sa visite en 1887 : 'Au cours des dernières années, l'ensemble de la distillerie a été presque entièrement renouvelé, reconstruit dans un style plus grand et plus moderne, et la distillerie comprend désormais tous les derniers progrès de la technologie de distillation.' C'était l'une des plus grandes distilleries des Highlands de l'époque. Mackenzie transforma l'entreprise en société anonyme en 1890, et fusionna avec Talisker en 1898 pour former Dailuaine-Talisker Distilleries Ltd. À cette époque, la gestion de l'entreprise était entre les mains du fils de Mackenzie, Thomas, qui avait fondé la distillerie Imperial l'année précédente. Thomas mourut en 1915 sans successeur, et Dailuaine-Talisker fut acquise par ses principaux clients Walker's, Dewar's, W.P. Lowrie et D.C.L. En 1917, un incendie majeur détruisit la majeure partie de la propriété, qui fut ensuite reconstruite. La distillerie fit l'objet d'une reconstruction majeure entre 1959 et 1960 ; le maltage au sol fut converti en système Saladin box, le nombre d'alambics passa de quatre à six, et un chauffage mécanique au charbon fut introduit (remplacé par un chauffage indirect en 1970). Parallèlement, la distillerie installa également une installation de grains noirs. L'orge cultivée localement fut utilisée jusqu'en 1983. Dailuaine a toujours été conçue pour produire du whisky pour assemblages et du malt whisky, et n'a été mise en bouteille en tant que single malt qu'en 1991.

Le toit en pagode de la distillerie Dailuaine — devenu par la suite la norme pour les distilleries de whisky de malt — a été détruit par un incendie en 1917. La distillerie a subi un autre incendie en 1959, provoquant les travaux de reconstruction mentionnés précédemment. En 1897, la distillerie a acheté une locomotive-selle 0-4-0 construite par Barclay of Kilmarnock pour transporter des marchandises à la gare de Carron. Elle a fonctionné jusqu'en 1939, lorsqu'elle a été remplacée par une autre locomotive du même fabricant, nommée plus tard "Dailuaine No. 1". Sa peinture vive et ses garnitures en laiton poli ont poussé un ancien conducteur à s'exclamer : "Extrêmement agréable à l'œil." Après la fermeture de la ligne de chemin de fer de Speyside en 1967, la locomotive a été donnée au musée du chemin de fer d'Aviemore. Elle a ensuite été restituée à U.D. (United Distillers) et est actuellement exposée à la distillerie d'Aberfeldy.