James Stuart, un marchand de grains de Rothes, constructeur et propriétaire du Macallan Distillery (1868-1886, voir « Glenrothes »), a construit Glen Spey (initialement un moulin à grains appelé Roslin Distillery Mill). Après avoir acheté le Macallan Distillery, il a vendu Glen Spey pour 11 000 livres au négociant en vins et spiritueux basé à Londres, W. & A. Gilbey. C'était la première fois qu'une entreprise anglaise achetait une distillerie de whisky écossais. En 1904, ils ont construit la distillerie Longmorn. En 1962, Gilbey a fusionné avec Justerini & Brooks, un autre négociant en vins et spiritueux de Londres de longue date qui avait connu un grand succès en Amérique avec le whisky mélangé J. & B. Rare. La nouvelle société a été nommée I.D.V. La capacité de production de Glen Spey a doublé en 1970. Deux ans plus tard, elle a été vendue au brasseur Watney Mann et la même année a été acquise par Grand Metropolitan. En 1997, Grand Metropolitan a fusionné avec Guinness pour former ce qui est maintenant connu sous le nom d'U.D.V. de Diageo. Glen Spey a longtemps été un malt clé pour l'assemblage J&B. Pendant un certain temps, c'était la marque de single malt du négociant en vins Unwin. Jusqu'en 2001, Glen Spey a été mis en bouteille en tant que single malt par son propriétaire U.D.V.

La distillerie Glen Spey garde un profil bas, nichée sur la rue principale de Rothes, sous les murs survivants de l'autrefois redoutable château de Rothes. Le château date du XIIIe siècle et a accueilli le roi Édouard Ier d'Angleterre en 1296. En 1309, il était entre les mains de la puissante famille Leslie, qui devint comtes de Rothes au XVIe siècle et brièvement ducs de Rothes en 1680 (un titre qui ne dura qu'un an). En 1662, les habitants brûlèrent le château et les bâtiments adjacents pour empêcher qu'ils ne servent de repaire aux voleurs. À l'époque du chauffage direct au charbon et de l'éclairage à flamme nue, les distilleries étaient fréquemment ravagées par le feu (voir Talisker, Glenrothes, Glenlossie, etc.). Glen Spey elle-même a été gravement endommagée par un incendie majeur en 1920.