L'un des premiers auteurs modernes sur le whisky écossais fut Sir Robert Bruce Lockhart (auteur de 'Scotch', 1951). Son arrière-arrière-grand-père James MacGregor faisait distiller illégalement de l'orge à Balmenach jusqu'à ce qu'il obtienne l'un des premiers permis de distillation dans la région de Speyside en 1823. Lorsque James mourut en 1878, son frère John prit la direction de la distillerie (abandonnant une carrière prometteuse en Nouvelle-Zélande). Alfred Barnard décrivit Balmenach au milieu des années 1880 comme 'appartenant au style le plus ancien… utilisant les alambics pot still et les fûts de chêne à l'ancienne comme sur l'image.' C'était le résultat d'une conception délibérée : John MacGregor refusait tout changement de peur de détruire le caractère et la qualité du whisky. En 1897, son fils, un autre James, prit la direction de la distillerie. Il forma une société limitée, Balmenach-Glenlivet Ltd, et apporta plusieurs améliorations, y compris une voie de garage avec une locomotive à vapeur, qui cessa d'opérer en octobre 1968, quelques jours avant la fermeture de la ligne de Speyside elle-même. En 1922, la famille MacGregor vendit la distillerie à une société de blending, qui devint partie de D.C.L. (le prédécesseur de Diageo) en 1925. Sous la direction de S.M.D. (également prédécesseur de Diageo), Balmenach passa de quatre à six alambics en 1960 — une marque de qualité supérieure que de nombreux blenders classaient comme spiritueux de premier ordre. En 1964, les floor maltings furent remplacés par des boîtes Saladin. La salle de mouture fut reconstruite en 1968, et une usine de dark grains fut installée dix ans plus tard. Tout cela servait au 'Light Railway Scheme' standard, à la différence que Balmenach était conçu pour être entièrement alimenté par gravité, sans pompage requis entre le remplissage initial du wash still et le remplissage final des fûts (voir 'Caol Ila'). Balmenach fut mise en sommeil en 1993 et vendue à Inver House Distillers en 1997. La production reprit l'année suivante. Les nouveaux propriétaires n'acquirent pas les stocks précédents, ce qui explique pourquoi ce fin single malt n'est pas facile à trouver aujourd'hui. En 2001, Inver House fut acquise par une filiale de ThaiBev plc et fusionnée dans la division internationale de la société, International Beverage Holdings (InterBev), en 2006.

En 1690, les Haughs of Cromdale, aux abords de la distillerie, furent le théâtre d'une bataille décisive où une force jacobite fut prise en embuscade par les dragons du gouvernement sous couvert de la nuit. Pendant la Seconde Guerre mondiale, la distillerie tomba silencieuse, comme la plupart de ses consœurs, et Balmenach fut réquisitionné comme caserne pour le Corps royal des transmissions. Dans les années 1990, l'embouteilleur indépendant basé à Glasgow, Aberfoyle & Knight, a fait revivre cet esprit sous l'évocateur label 'Deerstalker'.