La distillerie Linkwood a été fondée en 1821 par Peter Brown, agent et réformateur agricole du domaine de Linkwood, et a commencé ses opérations trois ans plus tard. Après 1842, James Walker de la distillerie Aberlour (qui a ensuite fondé James Walker & Company) a géré la distillerie. À la mort de Peter Brown en 1868, la distillerie a été transmise à son fils William, qui l'a démolie et reconstruite en 1874. L'entreprise familiale a été constituée en société anonyme en 1897 sous le nom de Linkwood-Glenlivet Distillery Company Ltd. Cinq ans plus tard, Innes Cameron, courtier en whisky d'Elgin, a rejoint le conseil d'administration et a contrôlé l'entreprise jusqu'à sa mort en 1932, année où la distillerie a été acquise par D.C.L. La distillerie a fait l'objet de rénovations majeures en 1963. En 1971, une nouvelle distillerie de style "Waterloo Street" a été construite à côté de l'original, portant le nombre d'alambics à quatre, témoignant de la qualité exceptionnelle et de la demande pour son spiritueux. Linkwood est classé comme un whisky de malt premium et sert d'alcool de base important pour « améliorer » plusieurs whiskies de mélange renommés. La nouvelle installation a été désignée Linkwood B et a fonctionné en parallèle avec l'original Linkwood A jusqu'à la fermeture de ce dernier en 1985. Les spiritueux des deux distilleries étaient mélangés avant leur mise en fût. En 2011, la distillerie a fermé pendant six mois pour installer de nouvelles cuves de brassage et des systèmes de contrôle. En avril 2013, le bâtiment original a été démoli pour agrandir la salle des alambics de Linkwood B, intégrant les deux alambics restants de Linkwood A et six nouvelles cuves de fermentation.

En 1936, Roderick Mackenzie a été nommé directeur de Laphroaig. Originaire de Wester Ross et parlant le gaélique, il a supervisé la production de la distillerie pendant des années avec une minutie sans faille, refusant de remplacer un équipement à moins que ce soit absolument nécessaire. Selon le professeur R.J.S. MacDougall, il refusait même d'enlever les toiles d'araignée de peur d'altérer le caractère de la distillerie. La référence du professeur MacDougall concerne la rénovation de 1962-1963, lorsque les nouveaux alambics furent des répliques exactes des anciens, conformément à la tradition de S.M.D.