William Mackenzie fundou a Dailuaine em 1851 em uma pequena floresta a cerca de uma milha da estrada principal, localizada na outra extremidade (extremidade norte) da propriedade de Ballindalloch, em frente ao Cragganmore. Doze anos depois, a Ferrovia de Speyside foi construída até Carron na margem oposta do rio e conectada à destilaria por uma ponte rodoviária pública, o que facilitou enormemente o acesso da Dailuaine ao mercado. A destilaria foi reconstruída em 1884, e Alfred Barnard observou durante sua visita em 1887: 'Nos últimos anos, toda a destilaria foi quase completamente renovada, reconstruída em um estilo maior e mais moderno, e agora a destilaria inclui todos os últimos avanços da tecnologia de destilação.' Era uma das maiores destilarias das Highlands da época. Mackenzie transformou a empresa em sociedade anônima em 1890, e fundiu-se com a Talisker em 1898 para formar a Dailuaine-Talisker Distilleries Ltd. Na época, os negócios da empresa estavam nas mãos do filho de Mackenzie, Thomas, que havia fundado a Imperial Distillery no ano anterior. Thomas morreu em 1915 sem sucessor, e a Dailuaine-Talisker foi adquirida por seus principais clientes Walker's, Dewar's, W.P. Lowrie e D.C.L. Em 1917, um grande incêndio destruiu a maior parte da propriedade, que foi posteriormente reconstruída. A destilaria passou por uma reconstrução importante entre 1959 e 1960; a malteação no chão foi convertida para o sistema Saladin box, o número de alambiques aumentou de quatro para seis, e foi introduzido o aquecimento mecânico a carvão (alterado para aquecimento indireto em 1970). Ao mesmo tempo, a destilaria também instalou uma instalação de grãos escuros. Cevada cultivada localmente foi utilizada até 1983. A Dailuaine foi sempre projetada para produzir whisky para blends e whisky maltado, e só foi engarrafada como single malt em 1991.

O telhado em pagode da destilaria Dailuaine — que mais tarde se tornou padrão para destilarias de whisky de malte — foi destruído por fogo em 1917. A destilaria sofreu outro incêndio em 1959, levando à obra de reconstrução mencionada anteriormente. Em 1897, a destilaria comprou uma locomotiva sela 0-4-0 construída pela Barclay of Kilmarnock para transportar mercadorias para a estação de Carron. Operou até 1939, quando foi substituída por outra locomotiva do mesmo fabricante, posteriormente chamada "Dailuaine No. 1". Sua pintura brilhante e seus acessórios de latão polido levaram um ex-motorista a exclamar: "Extremamente agradável aos olhos." Após o encerramento da linha ferroviária de Speyside em 1967, a locomotiva foi doada ao Museu Ferroviário de Aviemore. Mais tarde foi devolvida à U.D. (United Distillers) e está atualmente em exibição na destilaria de Aberfeldy.