1825년 제임스 고든과 피터 위어는 옛 애버러 하우스(Aberlour House)의 부지에 증류소를 설립했습니다. 1833년 사업이 실패하자, 증류소는 존 그랜트와 제임스 그랜트 형제가 워커 형제와 제휴하여 인수했습니다. 1840년 임대 계약이 종료되자, 그랜트 가족은 로시스로 이주하여 글렌그랜트 증류소를 건설했습니다. 피터 위어의 아들은 그들의 비즈니스 프로모터가 되었고, 워커 형제는 링크우드 증류소로 갔습니다. 현재의 애버러 증류소는 1879년부터 1880년 사이에 제임스 플레밍(1879년까지 다일루에인 증류소를 임대했던 지역 사업가)에 의해 건설되었습니다. 새 증류소는 옛 부지에서 1마일 떨어진 곳에 위치했으며, 토머스 텔포드가 크레이겔라키에 다리를 건설할 때 사용했던 채석장의 돌을 사용했습니다. 증류소는 1892년에 확장되었고, 그린녹의 블렌딩 회사 R. 소른 & 선스로 소유권이 이전되었습니다. 1898년 증류소는 화재로 파괴되고 재건되었습니다. 다음 소유주는 영국 회사 W.H. 홀트 & 선스로, 1921년에 애버러를 인수하여 20년간 운영했습니다. 1945년 S. 캠벨 & 선이 매입했고, 1973년 증류기 4기를 설치하는 등 설비를 현대화했으며, 다음 해에 페르노 리카드에 매각했습니다. 페르노 리카드는 2001년 시그램즈 인수(시바스 브라더스 포함)까지 캠벨 증류소를 자사 위스키 부문으로 유지했으며, 이후 시바스 브라더스가 모든 증류소를 인수했습니다. 2000년 이후 애버러 싱글 몰트 위스키 판매량은 특히 프랑스에서 급격히 증가했습니다. 이 브랜드는 현재 전 세계 6위의 가장 많이 팔리는 위스키 브랜드입니다. 2002년 8월, 증류소는 2시간의 투어를 제공하는 새로운 방문자 센터를 개설했습니다.

1990년대까지 증류소는 완전히 수력으로 운영되었습니다. 증류소 내에는 성 콜럼바의 추종자였던 성 드로스탄을 기리는 성배수(聖井水)가 있습니다. 그는 기원후 660년경 스페이사이드를 방문했습니다. 전설에 따르면 그가 이 우물물로 지역 주민들에게 세례를 베풀었다고 합니다. 나중에 그는 애버딘셔의 디어에 수도원을 세워 유명한 '북 오브 디어(Book of Deer)'를 저술했습니다. 1931년 로스 가문은 이 성인을 기리기 위해 작은 예배당을 특별히 지었습니다. 1992년에 세상을 떠난 이언 미첼은 48년간 증류소에서 근무했으며, 마지막 27년간은 증류소장을 역임했습니다. 그의 조부, 아버지, 형도 증류소에서 일했습니다. 아벨라워의 '아부나두(A'bunadh)' 시리즈(게일어로 '기원'이라는 뜻)는 2000년에 출시되었습니다. 이것은 원통 강도(cask strength), 비냉동 필터링(non-chill filtered)된 스페이사이드 제품입니다. 2019년까지 총 64배치가 출시되었습니다. 아벨라워 하우스는 현재 유명한 쇼트브레드 브랜드 '워커스 오브 아벨라워(Walkers of Aberlour)'의 본사입니다.